Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tdrd3Q91W18 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd3Q91W18 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms