Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf4Q8VE97 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms