Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Ssh3Q8K330 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Ssh3Q8K330 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Ssh3Q8K330 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Ssh3Q8K330 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Ssh3Q8K330 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Ssh3Q8K330 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ssh3Q8K330 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms