Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Neurl3Q8CJC5 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Neurl3Q8CJC5 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Neurl3Q8CJC5 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Neurl3Q8CJC5 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Neurl3Q8CJC5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Neurl3Q8CJC5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Neurl3Q8CJC5 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms