Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Mterf1aQ8CHZ9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Mterf1aQ8CHZ9 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Mterf1aQ8CHZ9 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mterf1aQ8CHZ9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms