Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms