Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Usp27Q8CEG8 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Usp27Q8CEG8 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Usp27Q8CEG8 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Usp27Q8CEG8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Usp27Q8CEG8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Usp27Q8CEG8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Usp27Q8CEG8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Usp27Q8CEG8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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