Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms