Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fbxo48Q8CAT8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fbxo48Q8CAT8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fbxo48Q8CAT8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fbxo48Q8CAT8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fbxo48Q8CAT8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fbxo48Q8CAT8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fbxo48Q8CAT8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fbxo48Q8CAT8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fbxo48Q8CAT8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fbxo48Q8CAT8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fbxo48Q8CAT8 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fbxo48Q8CAT8 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fbxo48Q8CAT8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fbxo48Q8CAT8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fbxo48Q8CAT8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fbxo48Q8CAT8 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms