Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsfm13Q8BXS2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 404.4 ms