Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP97

Rhbdd3, Rhomboid domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd3Q8BP97 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rhbdd3Q8BP97 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rhbdd3Q8BP97 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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