Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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