Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChfrQ810L3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms