Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm21943-201ENSMUST00000178181 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ClmQ7TSN2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms