Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrc2bQ7TPM1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms