Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ssxb10Q6XAR7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ssxb10Q6XAR7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ssxb10Q6XAR7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ssxb10Q6XAR7 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ssxb10Q6XAR7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ssxb10Q6XAR7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ssxb10Q6XAR7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ssxb10Q6XAR7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ssxb10Q6XAR7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ssxb10Q6XAR7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ssxb10Q6XAR7 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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