Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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