Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmeff1Q6PFE7 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms