Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Vstm2lQ6PDS0 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Vstm2lQ6PDS0 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Vstm2lQ6PDS0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Vstm2lQ6PDS0 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Vstm2lQ6PDS0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vstm2lQ6PDS0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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