Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp49Q6P9L4 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms