Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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