Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pkp4Q68FH0 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pkp4Q68FH0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pkp4Q68FH0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pkp4Q68FH0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pkp4Q68FH0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pkp4Q68FH0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pkp4Q68FH0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pkp4Q68FH0 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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