Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms