Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AtrxQ61687 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
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AtrxQ61687 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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AtrxQ61687 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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AtrxQ61687 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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AtrxQ61687 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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AtrxQ61687 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms