Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms