Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csnk2a1Q60737 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms