Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3aQ60520 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms