Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms