Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtl5Q5DTT4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms