Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms