Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms