Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnpc3Q3UZ01 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms