Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kdm5aQ3UXZ9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Kdm5aQ3UXZ9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdm5aQ3UXZ9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Kdm5aQ3UXZ9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Kdm5aQ3UXZ9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Kdm5aQ3UXZ9 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Kdm5aQ3UXZ9 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Kdm5aQ3UXZ9 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms