Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BB287469Q3UT53 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms