Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms