Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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