Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms