Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rnf40Q3U319 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rnf40Q3U319 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rnf40Q3U319 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rnf40Q3U319 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rnf40Q3U319 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rnf40Q3U319 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rnf40Q3U319 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Rnf40Q3U319 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Rnf40Q3U319 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Rnf40Q3U319 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf40Q3U319 Gm14481-201ENSMUST00000117178 629 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms