Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sec24aQ3U2P1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms