Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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