Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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