Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms