Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms