Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnnm1Q0GA42 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnnm1Q0GA42 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms