Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cnn1Q08091 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cnn1Q08091 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms