Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Thbs3Q05895 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Thbs3Q05895 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Thbs3Q05895 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Thbs3Q05895 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Thbs3Q05895 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Thbs3Q05895 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Thbs3Q05895 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Thbs3Q05895 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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