Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms