Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms