Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Zbtb37-201ENSMUST00000159250 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Patj-205ENSMUST00000107030 2104 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 4930552P12Rik-201ENSMUST00000181198 2496 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Bfar-202ENSMUST00000069281 2456 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Olfr126-203ENSMUST00000217487 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms