Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pitx2P97474 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms